Chromatin regulatory factor gene abnormalities in MDS
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[[Wikipathologica-KDP]]
*MDS(myelodysplastic syndromes)におけるクロマチン制御因子...
全ゲノム解析で発見されたAML/ MDSの遺伝子異常
#br
SNPアレイや次世代シークエンサーをもちいたAML, MDSの網羅的...
具体的には, ''DNMT3AやTET2, IDH1/2''など%%%DNAのメチル化%...
#br
このような変異はエピジェネシス制御異常(=遺伝子発現の異常)...
#br
#contents
#br
**''isocitrate dehydrogenase1/ 2 (IDH1/ IDH2)'' [#s4f20959]
#br
この遺伝子のofficial name ''isocitrate dehydrogenase 1 (N...
&color(blue){''グリオーマ''};の大規模コーディングシークエ...
#ref(citrateCycle03.JPG,around,right,90%)
-正常IDH1/ 2は, いずれもクエン酸回路でNADPH依存性にイソク...
#br
-IDH1は細胞質に, IDH2はミトコンドリアに局在する。
#br
-MDSの約5%に変異が認められる。de novo AMLではIDH1/2変異は...
-IDH1およびIDH2の変異は互いに排他的で、TET2変異に対しても...
#br
-&color(red){''IDH1の変異アミノ酸はR132に, IDH2の変異では...
変異型と野生型の蛋白が二量体を形成することになる.
#br
-これら変異アミノ酸は酵素活性の重要な部位に相当し変異によ...
#br
-一方で機能獲得型の変異型酵素は, αケトグルタル酸(αKG)から...
#br
-異常産生された2ヒドロキシグルタル酸は''TET2蛋白あるいはK...
#br
-IDH1/2変異はTET2変異と排他的に認められ, このことはこれら...
&color(blue){異常IDH1/2により蓄積する2HGはαKGアナログとし...
-免疫染色が可能で 変異IDH1R132H蛋白に対する抗体が利用可...
#clear
**TET2- tet methylcytosine dioxygenase 2 [#f53e60c1]
MDSのSNPアレイ解析により, '''TET2''' (Ten-eleven transloc...
-'''TET2'''の変異はMDSやAMLの他 MPN, CMML, 二次性白血病な...
-'''TET2'''遺伝子変異はMDSの約20%に認められる¬e{:Delho...
-CMMLの一部では''片親性二倍体(UPD)''に伴いホモ接合性TET2...
--片親性ダイソミー uniparental disomy (UPD)~
「二本の染色体を片親から受け継ぐ異常」のこと。一般的に二...
-変異の多くは, &color(blue){ナンセンスあるいはフレームシ...
TET2, TET2に近いTET1他を含む, &color(red){TETファミリー蛋...
このように, TET2は''脱メチル化に関与''しており, 機能喪失...
''変異'''IDH1/2'''''はαKGを2-hydroxyglutarate(2-HG)へと変...
#br
#br
>--->>[[''TET2 mutationのページ>TET2 mutation]]を見る。
#br
**DNMT3A (DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha) [#...
'''DNMT3A'''変異はAMLの網羅的シーケンス解析により見出され...
'''DNMT1'''がDNA複製時において複製鎖をメチル化することに...
-MDSおよびCMMLにおいて8-15%に'''DNMT3A'''変異が認められる。
-AMLでは'''DNMT3A'''変異は20%ほどに認められるが&color(red...
-t(8;21), inv(16), t(15;17)などのいわゆるfavorable riskの...
-M4, M5の病型についてもMLL転座やMLL-ITDあるいは、これらと...
-'''DNMT3A'''変異陽性症例はFLT3, IDH1/2, NMP遺伝子変異と...
-'''DNMT3A'''変異陽性AMLでは寛解率, 全生存率が有意に低く...
AMLでのDNMT変異のほとんどはメチル基転移酵素活性を担うC末...
&color(red){R822変異体のメチル基転移酵素活性の低下が最も...
**ASXL1 (additional sex comb-like 1) [#f44ba0d5]
&color(blue){''ASXL1 (additional sex comb-like 1)''};
>ショウジョウバエのadditional sex combs('''asx''')遺伝子...
&color(#c9171e){''遺伝的にtrithorax遺伝子およびpolycomb遺...
ASXL1変異はMDS, CMMLにおける変異遺伝子候補スクリ―ニングで...
-AML, MDSでは～20%, CMMLでは～45%, PMFで～20-40%と報告で...
PVおよびETでは比較的少ない。
-MDS, CMMLにおいてはASXL1変異陽性例はAMLへの進展率が有意...
-&color(red){変異のほとんどは''exon12にコードされるC末端...
-ASXL1ノックアウトマウスではリンパ球および骨髄系前駆細胞...
#br
#br
**ポリコーム群遺伝子 polycomb group genes [#i32a66a1]
&aname(piyo){''ポリコーム群(polycomb group: PcG)遺伝子''};
>ポリコーム群(polycomb group: PcG)遺伝子は''一度決定され...
>一例として, ショウジョウバエの[[ホメオボックス遺伝子>Hom...
しかし&color(red){ホメオボックス遺伝子の発現パターンはク...
''ヒトPcG複合体''
>PcG複合体は生化学的にPRC(=Polycomb repressive complex)1...
>PRC1は哺乳類にはこれらのホモログが複数種存在し, HPC1/2, ...
>ヒトPCR2は&color(red){EZH2, EED, SUZ12};のコアタンパク質...
''Polycomb'':
>ショウジョウバエHOX遺伝子群に関する先駆的な研究でノーベ...
>Pcグループ遺伝子の中で状況に応じてHox遺伝子の活性化もし...
-ショウジョウバエのasxはpolycomb遺伝子産物であるcalypso( ...
--[[''The ASXL-BAP1 axis: new factors in myelopoiesis, ca...
#br
-ヒト野生型のASXL1はcalypso(ヒトBAP1相同遺伝子)と関連して...
#br
-近年, ASXL1発現は, 転写抑制に働く''ヒストンのH3K27me3の...
''ASXL1は種々の遺伝子部位においてPRC2複合体のリクルートお...
#br
-PRC2の因子,&color(red){''EZH2,SUZ12''};はいずれも骨髄性...
#br
-ヒトにおいてはASXL1はBAP1とRP-DUBを形成しH2Aの脱ユビキチ...
&ref(MDSmuta01.jpg); &ref(ASXL_PRC2.jpg,,90%);
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[[Wikipathologica-KDP]]
*MDS(myelodysplastic syndromes)におけるクロマチン制御因子...
全ゲノム解析で発見されたAML/ MDSの遺伝子異常
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SNPアレイや次世代シークエンサーをもちいたAML, MDSの網羅的...
具体的には, ''DNMT3AやTET2, IDH1/2''など%%%DNAのメチル化%...
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このような変異はエピジェネシス制御異常(=遺伝子発現の異常)...
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**''isocitrate dehydrogenase1/ 2 (IDH1/ IDH2)'' [#s4f20959]
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この遺伝子のofficial name ''isocitrate dehydrogenase 1 (N...
&color(blue){''グリオーマ''};の大規模コーディングシークエ...
#ref(citrateCycle03.JPG,around,right,90%)
-正常IDH1/ 2は, いずれもクエン酸回路でNADPH依存性にイソク...
#br
-IDH1は細胞質に, IDH2はミトコンドリアに局在する。
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-MDSの約5%に変異が認められる。de novo AMLではIDH1/2変異は...
-IDH1およびIDH2の変異は互いに排他的で、TET2変異に対しても...
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-&color(red){''IDH1の変異アミノ酸はR132に, IDH2の変異では...
変異型と野生型の蛋白が二量体を形成することになる.
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-これら変異アミノ酸は酵素活性の重要な部位に相当し変異によ...
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-一方で機能獲得型の変異型酵素は, αケトグルタル酸(αKG)から...
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-異常産生された2ヒドロキシグルタル酸は''TET2蛋白あるいはK...
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-IDH1/2変異はTET2変異と排他的に認められ, このことはこれら...
&color(blue){異常IDH1/2により蓄積する2HGはαKGアナログとし...
-免疫染色が可能で 変異IDH1R132H蛋白に対する抗体が利用可...
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**TET2- tet methylcytosine dioxygenase 2 [#f53e60c1]
MDSのSNPアレイ解析により, '''TET2''' (Ten-eleven transloc...
-'''TET2'''の変異はMDSやAMLの他 MPN, CMML, 二次性白血病な...
-'''TET2'''遺伝子変異はMDSの約20%に認められる¬e{:Delho...
-CMMLの一部では''片親性二倍体(UPD)''に伴いホモ接合性TET2...
--片親性ダイソミー uniparental disomy (UPD)~
「二本の染色体を片親から受け継ぐ異常」のこと。一般的に二...
-変異の多くは, &color(blue){ナンセンスあるいはフレームシ...
TET2, TET2に近いTET1他を含む, &color(red){TETファミリー蛋...
このように, TET2は''脱メチル化に関与''しており, 機能喪失...
''変異'''IDH1/2'''''はαKGを2-hydroxyglutarate(2-HG)へと変...
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>--->>[[''TET2 mutationのページ>TET2 mutation]]を見る。
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**DNMT3A (DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha) [#...
'''DNMT3A'''変異はAMLの網羅的シーケンス解析により見出され...
'''DNMT1'''がDNA複製時において複製鎖をメチル化することに...
-MDSおよびCMMLにおいて8-15%に'''DNMT3A'''変異が認められる。
-AMLでは'''DNMT3A'''変異は20%ほどに認められるが&color(red...
-t(8;21), inv(16), t(15;17)などのいわゆるfavorable riskの...
-M4, M5の病型についてもMLL転座やMLL-ITDあるいは、これらと...
-'''DNMT3A'''変異陽性症例はFLT3, IDH1/2, NMP遺伝子変異と...
-'''DNMT3A'''変異陽性AMLでは寛解率, 全生存率が有意に低く...
AMLでのDNMT変異のほとんどはメチル基転移酵素活性を担うC末...
&color(red){R822変異体のメチル基転移酵素活性の低下が最も...
**ASXL1 (additional sex comb-like 1) [#f44ba0d5]
&color(blue){''ASXL1 (additional sex comb-like 1)''};
>ショウジョウバエのadditional sex combs('''asx''')遺伝子...
&color(#c9171e){''遺伝的にtrithorax遺伝子およびpolycomb遺...
ASXL1変異はMDS, CMMLにおける変異遺伝子候補スクリ―ニングで...
-AML, MDSでは～20%, CMMLでは～45%, PMFで～20-40%と報告で...
PVおよびETでは比較的少ない。
-MDS, CMMLにおいてはASXL1変異陽性例はAMLへの進展率が有意...
-&color(red){変異のほとんどは''exon12にコードされるC末端...
-ASXL1ノックアウトマウスではリンパ球および骨髄系前駆細胞...
#br
#br
**ポリコーム群遺伝子 polycomb group genes [#i32a66a1]
&aname(piyo){''ポリコーム群(polycomb group: PcG)遺伝子''};
>ポリコーム群(polycomb group: PcG)遺伝子は''一度決定され...
>一例として, ショウジョウバエの[[ホメオボックス遺伝子>Hom...
しかし&color(red){ホメオボックス遺伝子の発現パターンはク...
''ヒトPcG複合体''
>PcG複合体は生化学的にPRC(=Polycomb repressive complex)1...
>PRC1は哺乳類にはこれらのホモログが複数種存在し, HPC1/2, ...
>ヒトPCR2は&color(red){EZH2, EED, SUZ12};のコアタンパク質...
''Polycomb'':
>ショウジョウバエHOX遺伝子群に関する先駆的な研究でノーベ...
>Pcグループ遺伝子の中で状況に応じてHox遺伝子の活性化もし...
-ショウジョウバエのasxはpolycomb遺伝子産物であるcalypso( ...
--[[''The ASXL-BAP1 axis: new factors in myelopoiesis, ca...
#br
-ヒト野生型のASXL1はcalypso(ヒトBAP1相同遺伝子)と関連して...
#br
-近年, ASXL1発現は, 転写抑制に働く''ヒストンのH3K27me3の...
''ASXL1は種々の遺伝子部位においてPRC2複合体のリクルートお...
#br
-PRC2の因子,&color(red){''EZH2,SUZ12''};はいずれも骨髄性...
#br
-ヒトにおいてはASXL1はBAP1とRP-DUBを形成しH2Aの脱ユビキチ...
&ref(MDSmuta01.jpg); &ref(ASXL_PRC2.jpg,,90%);
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